ثبتنام مربوط به دوره دکتری دانشگاهها از ۶ شهریور ماه آغاز شده و تا ۱۹ شهریور ماه ادامه دارد که پذیرفتهشدگان باید با مراجعه به سایت دانشگاهها از زمان دقیق ثبتنامها مطلع شوند.
ثبتنام پذیرفتهشدگان دوره دکتری دانشگاه آزاد نیز طی روزهای ۱۱ و ۱۲ شهریور ماه صورت میگیرد و عدم مراجعه پذیرفتهشدگان در روز و ساعت مقرر به منزله انصراف از ثبتنام تلقی میشود.
| ردیف | دانشگاه | تاریخ |
| ۱ | علامه | ۱۲ تا ۱۳ شهریور |
| ۲ | تهران | ۱۲ تا ۱۴ شهریور |
| ۳ | علم و صنعت | ۸ شهریور |
| ۴ | صنعتی شریف | ۱۱ تا ۱۲ شهریور |
| ۵ | یزد | ۶ تا ۱۰ شهریور |
| ۶ | اصفهان | ۸ تا ۱۱ شهریور |
| ۷ | شیراز | ۱۵ تا ۱۹ شهریور |
| ۸ | صنعتی امیرکبیر | ۱۳ تا ۱۴ شهریور |
| ۹ | شهید بهشتی | ۱۲ تا ۱۳ شهریور |
| ۱۰ | کردستان | ۷ تا ۸ شهریور |
| ۱۱ | شهید چمران اهواز | ۱۲ تا ۱۳ شهریور |
| ۱۲ | لرستان | ۱۲ تا ۱۵ شهریور |
| ۱۳ | مازندران | ۱۱ تا ۱۳ شهریور |
| ۱۴ | آزاد | ۱۱ تا ۱۲ شهریور |
در آزمون دوره دکتری سال ۹۶ تعداد ۲۶۰ هزار و ۵۲۰ داوطلب ثبتنام کردند که تعداد ۲۱۲ هزار و ۹۴۱ داوطلب در جلسه آزمون حاضر بودند و در نهایت ۱۹۹ هزار و ۳۰۳ داوطلب مجاز به انتخاب رشته شدند.