پس از تعیین نقطه صفر مرزی بین دو کشور درباره تعیین گذرگاه های مرزی توافق خواهد شد. هر یک از گذرگاه ها کاربرد خاصی برای تبادل تجاری، صادرات نفت و تردد مسافران خواهد داشت.
عمر البشیر ،رئیس‌جمهور سودان و سالوا کیه‌ر، رئیس‌جمهور سودان‌جنوبی در دیدار خود در جوبا علاوه بر توافق درخصوص ترسیم خط مرزی ،پذیرفتند تا پیش از پانزدهم ماه نوامبر آینده درباره توقف حمایت از شورشیان توافق‌نامه‌ای را امضا کنند.
دو کشور همچنان درباره سرنوشت منطقه ابیی که ذخایر عظیم نفتی در آن وجود دارد با یکدیگر اختلاف دارند. بنابراین بر اساس توافق دو طرف ،کمیته مشترک نظارت بر صادرات نفت بین دو کشور فعالیت خود را آغاز می‌کند.
سودان و سودان جنوبی با وجود اختلافات سیاسی با یکدیگر منافع اقتصادی مشترکی دارند که دو کشور را به سوی همکاری ترغیب می‌کند.