اين تيم در سال 1327 با كمك حكيم شوشتري در اهواز تاسيس شد. اين تيم يكي از مشتقات باشگاه تاج تهران (استقلال امروزي) بود و تاج اهواز خوانده مي‌شد. از همان ابتدا هم اين تيم توانست گروهي از بازيكنان خوب خوزستاني را جذب خود كند.

در سال 1352 اين تيم امتيازهاي لازم براي حضور در ليگ تخت جمشيد را به دست آورد اما چون در قوانين ذكر شده بود كه با يك نام مشترك تنها يك تيم مي‌تواند در ليگ حضور يابد، تاج تهران در ليگ شركت كرد و تاج اهواز از حضور در آن باز ماند.

پس از انقلاب اين تيم نامش را به استقلال اهواز تغيير داد. جنگ تحميلي سبب شد باشگاه از رونق بيفتد. در سال 1370 اين تيم توانست در جام آزادگان حضور يابد و دو تيم استقلال اهواز و استقلال تهران اجازه يافتند همزمان در ليگ‌برتر حضور داشته باشند.

رنگ لباس اول اين تيم آبي و لباس دوم آنها سفيد است.